Галопом по генетическим «европам»: Открытое письмо Сергею Апрятину или Рецензия на одно «издание»

Аватар пользователя ОгнеЛо

Сказать, что я разочарована, это ничего не сказать — слов нет... ТАКОГО псевдонаучного бреда я ещё не читывала...
Уж лучше никак, чем ТАК!
В общем, «не могу молчать» © [автора не помню]

...нельзя быть современным биологом
не зная генетики
С.Г. Инге-Вечтомов

...журнал «Генетика гуппи»... какое многообещающее название... и целевая аудитория, вроде бы, подходящая... и автор, вроде бы, кандидат биологических наук и цитолог... вроде бы, увлекается гуппи... вроде бы, имеет опыт ведения научных исследований и преподавания... вроде бы, имеет навык написания статей, в т.ч. научных...
Напомню, что автор себя позиционирует следующим образом:
Сергель :

...В 2000 году окончил биологический факультет (кафедра клеточной физиологии и иммунологии, сейчас — кафедра физиологии микроорганизмов) по специальности микробиология (специализация — иммунология).
Кандидат биологических наук по специальности «Аллергология и иммуноогия».

Старший научный сотрудник лаборатории молекулярной биологии Московского НИИ медицинской экологии, преподаватель кафедры биохимии Московской медицинской академии им. И.М. Сеченова (1-й Мед) с 2005 по 2008 гг.

С 1998 года по 2004 год занимался разработкой диагностических тест-систем и первой отечественной вакциной против ВИЧ/СПИДа (сейчас вакцина проходит клинические испытания).
В настоящее время занимаюсь исследованием генетических маркеров для дифференциальной диагностики доброкачественных и злокачественных новообразований предстательной железы (рак простаты, аденома и т.д.).
Более 40 научных и научно-популярных статей в отечественых и зарубежных журналах и другой печатной периодике (в том числе “Aquarium magazine”, «Аквариум», «Современный аквариум», «Рыбалка на Руси», «На рыбалку», «Иммунология», «Генетика», «Стоматология Today» и др.), 1 методическое пособие и 1 патент РФ.

свое «издание» таким:

Т.е., как минимум, можно было предположить, что нам, неофитам, расскажут понятным языком, «что, как и почему» нужно делать, объяснят непонятное... Что же мы получили в итоге?
Замечания:
1. Я, по специальности, не биолог.
2. Образование — высшее.
3. Иностранными языками — не владею.
4. Читать и пользоваться литературой — умею.
5. Орфография приводимых цитат сохранена.
6. Имеющийся объём знаний позволяет оценить данное «издание» безличностно.
7. Обижаться на данное письмо — глупо, ибо — на правду не обижаются.
8. Всем желающим принять участие в дискуссии рекомендую почитать соответствующие материалы, например:

  • Крестьянинов Ю.В., Вайнер Г.В. Сборник задач по генетике с решениями: Методическое пособие. — Саратов: «Лицей», Б.г. [он-лайн версия]
  • Лобашев М.Е. Генетика: Учебное пособие. — Л.: Изд-во Ленинградского ун-та. 1969. — 752 с.
  • Медведев Н.Н. Практическая генетика. 2-е изд., перераб. и доп. — М.: Наука, 1968. — 294 с.
  • Серебровский А. С. Генетический анализ: Монография. — М.: Наука, 1970. — 342 с.
  • Инге-Вечтомов С.Г. Генетика с основами селекции. — М.: Высш. шк., 1989. — 591 с.
  • Генетика: Уч. / Под ред. В.И. Иванова. — М.: ИКЦ «Академкнига», 2006. — 638 с.
  • Ли Ч. Введение в популяционную генетику. М.: Мир, 1978. — 557 с.
  • Барабанщиков Б.И., Сапаев А.Е. Сборник задач по генетике. — Казань, Изд-во Казанского университета, 1988. — 192 с.
  • Генетика в вопросах и ответах / Е.И. Морозова, Е.И. Тарасевич и др. — Мн.: Университетское, 1989. — 288 с.
  • Тихомирова М.М. Генетический анализ. — Л.: Изд-во ЛГУ, 1990. — 280 с.
  • Кирпичников В.С. Генетика и селекция рыб. 2-е изд. Л.: Наука, 1987. 520 с. (47,6 MB pdf)
  • Льюин Б. Гены. М.: Мир, 1987. — 544 с.
  • Сингер М., Берг П. Гены и геномы: в 2-х т. — М.: Мир., 1998.
  • Ветеринарная генетика / В.Л. Петухов, А.И. Жигачев и др. — М.: Колос, 1996. — 384 с.
  • Айала Ф., Кайгкр Дж. Современная генетика: в 3-х т. — М.: Мир, 1987, 1988.
  • Анализ генома. Методы /Под ред. К. Дейвиса. — М.: Мир,1990. — 264 с.
  • Genetic linkage map of the guppy, Poecilia reticulata, and quantitative trait loci analysis of male size and colour variation / N. Tripathi, M. Hoffmann, E.-M. Willing, Chr. Lanz, D. Weigel and Chr. Dreyer (текст на английском языке)
  • геном гуппи
Прочла первый номер — промолчала... другие — высказались:

euggn :

Журнал почитал он-лайн.

Впечатления — двойственные.

С одной стороны — земной поклон за перевод и вклад в популяризацию...

С другой — пожелание покорректнее компилировать и соблюдать общепринятые нормы в части авторских прав

и 

euggn :

когда взрослый, как любит говорить Слава — половозрелый человек, с неплохим образованием берет чужой материал (допустим, малоизвестный, широким кругам аквариумистов в России, потому что он, скажем, в оригинале — на другом языке) — он, вообще-то не должен, на радостях от великой находки, лепить его под своей фамилией и защищать, типа копирайтом (насчет ссылок и разрешений). Отчасти потому, что сам «ссылками и разрешениями» вообще не парился, а главным образом — потому, что у пишущих людей есть правила на сей счет: материал целиком — с разрешения, как перевод, выдержки — цитатой или сноской, компилляцию по источникам — с библиографией.

А иначе это называется — «воровство».

Мне же, журнал напомнил вот это:

один из вариантов известного анекдота :

— Папа, а почему, когда яблоко откусишь, оно делается коричневым?
— Дело в том, сынок, что в яблоке имеются различные химические вещества. Одно из них — железо. Так вот, когда железо вступает с кислородом, находящимся в воздухе, в химическую реакцию, получается окисление. В результате образуется вещество, которое и окрашивает яблоко в коричневый цвет.
— Папа, а с кем ты сейчас разговаривал?

замечу, что правильный ответ на заданный в анекдоте вопрос звучит так:

torontonian :

Как-то случайно выяснил, что некоторые действительно верят в это. Хотелось бы развеять заблуждение.
Яблоки темнеют совсем не от того, что в них якобы окисляется железо!
Мякоть яблок темнеет из-за окисления танинов и других фенольных соединений на воздухе. [выделено — мной, О-Л]

Прочтение второго номера лишь подтвердило сложившееся мнение.
Так, что же «не так» в рассматриваемом «журнале»?

Откроем, например, учебное пособие
Тихомирова М.М. Генетический анализ. — Л.: Изд-во ЛГУ, 1990. — 280 с.
и сравним то, чему учат биологов в вузе, с «трудами» авторов

. (8.83Mb, djvu) и
(3.94Mb. pdf), (2.39Mb. pdf)



Предупреждение:
Сергей, прошу не взваливать свои огрехи на Сторожева, вы — кандидат биологических наук [и прочая, и прочая...], В.В. — нет.
«Научная» компонента «издания» — ваша. И, к огромному сожалению, она не соответствует даже уровню первокурсника... Увы...



Постскриптум (добавлено 21.01.2010)
Факты таковы:
1. Обсуждения по СУЩЕСТВУ не получилось. И не только из-за того, что многим не понравилось моё решение публично озвучить эти вопросы. То, что авторам НЕЧЕГО ответить по СУЩЕСТВУ — очевидно. Переход на оскорбления это подтверждает.
2. Приношу свои извинения посетителям Aquaria2.RU, вынужденным читать грубости написанные некоторыми из участников этого обсуждения.
3. Если бы я знала раньше, что для одного из авторов главная проблема
hiv, 09.07.2008, 02:22 :

...Опять приходится сделать самое тяжеле в жизни - думать

то тему назвала бы не «Открытое письмо Сергею Апрятину», а «рецензия»...

В общем, я своё мнение высказала, проблему обозначила, аргументы привела — решать каждому САМОМУ.

Не имеющие отношения к проблеме мысли озвучить можно там



Добавлено 16.06.2010
Мнение Филипа Шеддока по поводу таблицы Сторожева-Апрятина можно прочитать на английском языке или воспользоваться автоматическим переводчиком, например от
ОгнеЛо
Аватар пользователя ОгнеЛо
Россия
Москва, Центр, м. Китай-город
Сообщения: 5398

Окончание цитаты с сайта «Генетика гуппи»



цитата:

----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---
Несколько слов о гуанофорах:

Шестигранные кристаллы гуанина располагаются в плазме гуанофоров и благодаря токам плазмы могут концентрироваться или распределяться по клетке. Это обстоятельство, с учетом угла падения света, приводит к изменению цвета покровов рыбы от серебристо-белого до синевато-фиолетового и сине-зеленого.

ГУАНОФОРЫ, РАСПОЛАГАЯСЬ В КОЖЕ НИЖЕ ОСТАЛЬНЫХ ПИГМЕНТНЫХ КЛЕТОК, В СОЧЕТАНИИ С КСАТОФОРАМИ И ЭРИТРОФОРАМИ ДАЮТ ЗЕЛЕНЫЙ, А С ЭТИМИ КЛЕТКАМИ И МЕЛАНОФОРАМИ - СИНИЙ!!!

У различных рыб голубая и синяя окраски поверхности тела различаются разными способами. Так, например, у рыбы-хирурга голубая окраска обусловлена расположением в коже гуанофоров с подстилающим их слоем меланофоров, причем голубая окраска возникает за счет интерференции света (наложении друг на друга близких по длинне волн - мой комментарий) в многослойных тонких пластинках кристаллов гуанина в гуанофорах, а синяя окраска обеспечивается меньшим кол-вом гуанофоров!!!

Дополнение к ксантофорам и эритрофорам:

В ксантофорах и эритрофорах могут находится птерины (как в комбинации с астаксантином или лютеином, так и без) - это красно-оранжевые пигменты, которые могут синтезироваться в организме рыб до того как она получит с пищей каротиноиды, а позже птерины заменяются на каротиноиды пищи, например астаксантин.

Птерины обеспечивают желтую, красную и оранжевую окраску в ксантофорах и эритрофорах.

По материалам монографии Микулина А.Е. "Функциональное значение пигментов и пигментации в онтогенезе рыб", М., 2000.



Для сведения:
Микулин А.Е. Функциональное значение пигментов и пигментации в онтогенезе рыб. — М.: ВНИИРО, 2000. — 232 с.
В монографии дан анализ современных представлений о физиолого-биохимических функциях пигментов у рыб, рассмотрены особенности пигментного состава икры и тканей рыб на разных этапах онтогенеза и в связи с экологией среды обитания. Это итоги научных исследований проведённых Микулиным Александром Евгеньевичем в рамках работы над докторской диссертацией на тему «Функциональное значение пигментов и пигментации в онтогенезе рыб», которая была успешно защищена в 1998 году.
ВНИИРО — Всероссийский научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии.
ОгнеЛо
Аватар пользователя ОгнеЛо
Россия
Москва, Центр, м. Китай-город
Сообщения: 5398

а вот и другой «секретный» библиографический источник, который авторы «забыли» упомянуть в своём «издании»



Начало цитаты с сайта «Генетика гуппи»
genetika-guppy, Четверг, 20.08.2009, 15:18 :

В этой теме я хочу рассказать о типах пигментных клеток и самих пигментах.
Пигментные клетки и типы пигментов, расположенные в них:

меланофоры –меланин (черный пигмент)

эритрофоры –астаксантин (красный пигмент)

ксантофоры –лютеин (желтый пигмент)

гуанофоры (синоним - ирридиофоры) –кристаллы гуанина (металлический блеск и серебристая окраска)

Расположение пигментных клеток в коже:

меланофры - во всех слоях кожи, в основном в верхних.

эритрофоры и ксантофоры – в основном в средних слоях кожи и редко встречаются в верхних слоях.

гуанофоры – в нижем слое кожи или сразу под ним.

Форма пигментных клеток:

меланофоры и эритрофоры - звездчатая форма

ксантофоры - округлая форма с амебовидными выростами

гуанофоры - разнообразная форма

Эмбриогенез и онтогенез пигментных клеток:

В эмбриональном развитии костистых рыб хроматофоры разных типов возникают в определенной последовательности. Сначала дифференцируются меланофоры дермы, затем ксантофоры и гуанофоры. В процессе онтогенеза от ксантофоров происходят эритрофоры.

----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---


ОгнеЛо
Аватар пользователя ОгнеЛо
Россия
Москва, Центр, м. Китай-город
Сообщения: 5398

Дык... «библиография»-то была озвучена КБНом на своём сайте в середине августа, а вот сослаться на него в «публикации» — «забыли», кстати, выходные данные Гордоновского труда КБН, почему-то, постеснялся озвучить. Читая фразу

genetika-guppy :

...из редкой коллекционной книги д-ра Мирона Гордона «Гуппи как домашние животные» 1955 г.
Эта уникальная книга в России к сожалению есть только в моей домашней библиотеке...

можно сделать ошибочный вывод, что эта книга вышла на РУССКОМ языке, возможно ограниченным тиражом и, учитывая год издания, стала библиографической редкостью... Правильное библиографическое описание, в данном случае, озвучила — я.
Более того, с конца июля они «открыли для себя» и «Генетический анализ» Тихомировой М.М., но почему-то решили «идти другим путём»...

Правда, необходимо отметить, что работали авторы очень «плодотворно», т.к. авторские «основные фундаментальные открытия» были сделаны в течение очень короткого периода — менее двух лет!
«Внушаитъ»
З.Ы. «жужжун» — пущай жужжит... дадим ему «позвездеть»
Для справки:
Например, Маркова О.А. исследования на тему «Использования аутосексных пар...» проводила в течение СЕМИ лет. Правда, это ДРУГОЙ — качественный уровень.

euggn
Аватар пользователя euggn
Россия
Москва
Сообщения: 2882

Марина, это "нешущештвенна" - пусть его жужжит, не мешает же...
Главное - несмотря на гордыню, "пошла библиография" (оказывается - "Измаил все-таки Суворов брал", а сколько было претензий и обвинений! ). То, что некоторые взгляды на генетику за полвека (после Гордона) были существенно уточнены - даже не второй, а третий вопрос.
Всему свое время.
Это Сторожев прекрасно подтверждает и уточняет с практических позиций, только, УВЫ, отдельно от издания - в обсуждениях.

КБН еще молодой, т.е. - обучаемый. Только на положительном подкреплении он не учится (наоборот, башню совсем, наглушняк срывает) - только на отрицательном... Но такое бывает. У собак тоже. Психотип такой.

euggn
Аватар пользователя euggn
Россия
Москва
Сообщения: 2882

Зато был опыт применения сей катушки. Ничо так аппарат.
Сорри за ОФФ.

Вот и пошли "источники середины прошлого века".

Так что "все ненапрасно" - не мытьем, так катаньем "пошла библиография" С приличествующими случаю понтами-распальцовками, но тем не менее... Уже что-то... Правда, боюсь, в таком разе мы не получим закон всемирного тяготения и таблицу умножения "от автора" (будут ссылки и упоминания), но согласись - уже что-то.

Только насчет "единственности экземпляра" к-б-н чуток погорячился... Я читал эту книгу больше двадцати лет назад... Она была у Василича. Еще одно издание Гордона наблюдалось в библиотеке Александра Сергеевича (ихтиолога ВНИИРО)... Думаю, этими двумя книгами Гордон в России тоже не "исчерпывался"...

"Есть много, друг Горацио, на свете, что и не снилось нашим мудрецам..." (С)

Хотя здесь уместнее:

If we offend -
It is with our good will...
But we had come...
Not for your offence...

Типа, тот же автор (не Апрятин, если кто сомневается)

ОгнеЛо
Аватар пользователя ОгнеЛо
Россия
Москва, Центр, м. Китай-город
Сообщения: 5398

Про лютиносов, во всяком случае, на примере волнистых попугайчиков писали ещё в 70-х годах, к сожалению книжка сейчас не доступна, поэтому и не цитирую.
А вот «карьер» из которого нарыли «пигментные гранулы» показала.
З.Ы. как правильно пишется «нассы» — не знаю, ибо нет опыта применения сего слова

ОгнеЛо
Аватар пользователя ОгнеЛо
Россия
Москва, Центр, м. Китай-город
Сообщения: 5398

а вот и цитаты из книги Gordon M. Guppies as pets. A guide to the selection, care and breeding of guppies. — Jersey City, N.J.: T. F. H. Publications, Inc.; 1955.
...про «пигментные гранулы», про альбиносов... правда, про «диаграмму» genetika-guppy несколько погорячился...



genetika-guppy, Пятница, 14.08.2009, 19:17 :

Некоторые интересные схемы и фотографии из редкой коллекционной книги д-ра Мирона Гордона "Гуппи как домашние животные" 1955 г.
Эта уникальная книга в России к сожалению есть только в моей домашней библиотеке и я спешу поделиться самым интересными материалами.
...
Рис. 2. Диаграмма, показывающая различные варианты фоновых окрасов гуппи в сравнении с альбиносами
(видно, что у гуппи со светлой фоновой кол-во меланофоров (пигментных клеток с черным пигментом меланином) такое же как и у серых гуппи, однако размер пигментных гранул меньше, а у гуппи с золотой фоновой размер пигментных гранул такой же как и у серых, но кол-во самих пигментных клеток в 2 раза меньше).
 T. F. H. Publications, Inc.; 1955.
Рис. 3. Результаты креста между альбиносом со скрытой серой фоновой и неальбиносом с золотой фоновой.
 T. F. H. Publications, Inc.; 1955.
Рис. 4. Наследование гена альбинизма у гуппи.
 T. F. H. Publications, Inc.; 1955.
Рис. 5. Пример Х-сцепленного наследования у гуппи на примере гена Zebrinus (Ze).
 T. F. H. Publications, Inc.; 1955.


euggn
Аватар пользователя euggn
Россия
Москва
Сообщения: 2882

Марина, "нассы" (точнее даже - "насЦы") - это довольно неплохая спиннинговая катушка, Фирмы Шимано.

Может, поэтому так?

Про биологию - улыбнуло... Что-то я припоминаю на эту тему изрядно было "странного".
Я так понимаю, Апрятин состарится с искренней верой в то, что лютино - это альбинос, а не ксанторная форма.
Печально. Очень печально... Хотя, вообще-то - закономерно и предсказуемо...

ОгнеЛо
Аватар пользователя ОгнеЛо
Россия
Москва, Центр, м. Китай-город
Сообщения: 5398

Окончание
а это обсуждение выложенного на форуме отчёта сайта



Владимир, Понедельник, 11.01.2010, 13:47 :

зря ты вставил в отчёт упоминание о сумашедших-что бы о чем то судить нужно хотя бы приблизительно быть в теме

genetika-guppy, Понедельник, 11.01.2010, 13:55 :
(Владимир) :

зря ты вставил в отчёт упоминание о сумашедших-что бы о чем то судить нужно хотя бы приблизительно быть в теме

Из песни слов не выкинешь.

В отчете мы говорим как об успехах, так и проблемах.
Делать вид что ничего не происходит тоже не выход.
Нужно просто разъяснить людям что происходит и мне кажется это удалось.

Владимир, Понедельник, 11.01.2010, 14:06 :

ну и ладно ,умные поймут что к чему,а дураки пусть далее свою глупость продвигают



Извините за грубость. Это именно тот случай, про который говорят «Нассы в глаза, всё — "божья" роса».
ОгнеЛо
Аватар пользователя ОгнеЛо
Россия
Москва, Центр, м. Китай-город
Сообщения: 5398

Продолжение


genetika-guppy, Понедельник, 11.01.2010, 01:37 :

...
Теперь что пока не удалось.
...
4.Общая оценка журнала «Генетика гуппи» – положительная, но, несмотря на это, часть аквариумистов посчитала журнал «слабым». Это странно, поскольку журнал является научно-популярным изданием, освещающим теоретические аспекты общей генетики, так и практические основы генетики и селекции гуппи. Мы пытаемся помочь начинающим селекционерам, часто не имеющим даже базового опыта в генетике и селекции и найти эту информацию в таком упрощенном виде где-либо часто просто не представляется возможности. Не говоря уже о людях преклонного возраста (в том числе и из регионов), для которых любое печатное издание по этой теме – «на вес золота». Люди пишут и пишут. Вернее за них пишут их молодые коллеги, поскольку наши «дедушки» редко пользуются Интернетом.

Истинные мотивы такой негативной оценки мне не ясны, о них можно лишь догадываться. Тем более что большая часть этих аквариумистов мало разбирается в биологии вообще и генетике в частности. Это прекрасно видно по их темам на различных форумах. К сожалению часто эти люди пользуются тем, что мало пользователей форумов знают биологию на достаточном уровне, а также тем, что модераторы форумов позволяют им безнаказанно хамить и высказывать абсолютно ненаучную, выдуманную точку зрения. Но факт остается фактом, и мы его ставим в общий ряд проблем. Это остается на их совести. Можно посоветовать только одно – поменьше обращать внимание на тех, кто много говорит, и побольше на тех, кто реально что-то делает.


Topic locked